Zowel landelijk als plaatselijk zijn er contacten met de Gereformeerde Kerken (vrijgemaakt) en de Christelijke Gereformeerde Kerken. Daarover nam de LV Houten 2010/2011 een groot aantal besluiten.
Nu de ‘toe-eigening van het heil’ niet langer een barrière vormt, gaan de gesprekken met de CGK op landelijk niveau een nieuwe fase in. De plaatselijke contacten met de CGK zijn de afgelopen jaren niet uitgebreid, die met de GKV daarentegen wel. Gesprekken met de GKV op landelijk niveau hebben geleid tot overeenstemming over een de wijze van omgaan met de Bijbel en over een aantal onderdelen van de leer van de kerk. De komende jaren worden deze gesprekken voortgezet, onder meer over de vrouw in het ambt. Wat de LV Houten 2010/2011 betreft richten deze gesprekken zich op alles wat nodig is om de belemmeringen voor de plaatselijke samenwerking en eenheid tussen NGK en GKV weg te nemen èn op landelijke eenheid tussen beide kerken. Met CGK en GKV participeren de NGK in het Deputatenoverleg Eenheid (DOE).
Verder nemen de NGK deel aan het Contactorgaan Gereformeerde Gezindte (COGG), is in 2010 een delegatie vanuit de kerken naar de Nationale Synode in Dordrecht geweest en zijn er verkennende contacten met de Raad van Kerken.